Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cln8Q9QUK3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cln8Q9QUK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cln8Q9QUK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms