Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Cabp1Q9JLK7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
Cabp1Q9JLK7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cabp1Q9JLK7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cabp1Q9JLK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,77■■■□□ 2,84
Cabp1Q9JLK7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32,72■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32,67■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Cabp1Q9JLK7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,61■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32,59■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32,59■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,81
Cabp1Q9JLK7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,55■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,54■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32,53■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Cabp1Q9JLK7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32,51■■■□□ 2,79
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