Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nova1Q9JKN6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nova1Q9JKN6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nova1Q9JKN6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nova1Q9JKN6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms