Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin1Q9JKF6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin1Q9JKF6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nectin1Q9JKF6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin1Q9JKF6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms