Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gpa33Q9JKA5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gpa33Q9JKA5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms