Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msgn1Q9JK54 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msgn1Q9JK54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msgn1Q9JK54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msgn1Q9JK54 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msgn1Q9JK54 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms