Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ddx20Q9JJY4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ddx20Q9JJY4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ddx20Q9JJY4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ddx20Q9JJY4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
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