Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc5a4aQ9ET37 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc5a4aQ9ET37 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a4aQ9ET37 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a4aQ9ET37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a4aQ9ET37 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a4aQ9ET37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a4aQ9ET37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a4aQ9ET37 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms