Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dkc1Q9ESX5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dkc1Q9ESX5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dkc1Q9ESX5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms