Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tlr6Q9EPW9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tlr6Q9EPW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tlr6Q9EPW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tlr6Q9EPW9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms