Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg9Q9DB90 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg9Q9DB90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smg9Q9DB90 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smg9Q9DB90 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms