Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc89Q9DA73 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc89Q9DA73 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc89Q9DA73 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms