Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smco2Q9DA21 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smco2Q9DA21 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smco2Q9DA21 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smco2Q9DA21 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms