Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pradc1Q9D9N8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pradc1Q9D9N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pradc1Q9D9N8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms