Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmd12Q9D8W5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd12Q9D8W5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms