Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms