Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufb8Q9D6J5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ndufb8Q9D6J5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufb8Q9D6J5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufb8Q9D6J5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms