Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al3Q9D4U4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al3Q9D4U4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al3Q9D4U4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms