Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Syce1Q9D495 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syce1Q9D495 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms