Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rufy3Q9D394 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rufy3Q9D394 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rufy3Q9D394 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms