Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rasgef1cQ9D300 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rasgef1cQ9D300 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rasgef1cQ9D300 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms