Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tspan11Q9D1D1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tspan11Q9D1D1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms