Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zbed3Q9D0L1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zbed3Q9D0L1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Zbed3Q9D0L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Zbed3Q9D0L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms