Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Nip7Q9CXK8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nip7Q9CXK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nip7Q9CXK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nip7Q9CXK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.8 ms