Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NubplQ9CWD8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NubplQ9CWD8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NubplQ9CWD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NubplQ9CWD8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms