Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd2aQ9CQJ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms