Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpa3Q9CQ71 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms