Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atg3Q9CPX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atg3Q9CPX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atg3Q9CPX6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg3Q9CPX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms