Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mccc1Q99MR8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mccc1Q99MR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mccc1Q99MR8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mccc1Q99MR8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms