Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pagr1aQ99L02 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pagr1aQ99L02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pagr1aQ99L02 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.8 ms