Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim11aQ99J19 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smim11aQ99J19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smim11aQ99J19 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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