Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmo1Q924W9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo1Q924W9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmo1Q924W9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms