Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y21

Pcdha1, Protocadherin alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha1Q91Y21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdha1Q91Y21 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdha1Q91Y21 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha1Q91Y21 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha1Q91Y21 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms