Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y20

Pcdha10, Protocadherin alpha-10, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha10Q91Y20 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdha10Q91Y20 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha10Q91Y20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha10Q91Y20 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdha10Q91Y20 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms