Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trex1Q91XB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trex1Q91XB0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trex1Q91XB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trex1Q91XB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trex1Q91XB0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trex1Q91XB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trex1Q91XB0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms