Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmco4Q91WU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmco4Q91WU4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmco4Q91WU4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms