Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acsl6Q91WC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acsl6Q91WC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl6Q91WC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms