Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx9Q91VH2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx9Q91VH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms