Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc71Q8VEG0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc71Q8VEG0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc71Q8VEG0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc71Q8VEG0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms