Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Fyco1Q8VDC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fyco1Q8VDC1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fyco1Q8VDC1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fyco1Q8VDC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fyco1Q8VDC1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms