Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc6a20aQ8VDB9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc6a20aQ8VDB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc6a20aQ8VDB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms