Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc18Q8VD24 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc18Q8VD24 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc18Q8VD24 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zcchc18Q8VD24 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc18Q8VD24 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
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