Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd300ldQ8VCH2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cd300ldQ8VCH2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd300ldQ8VCH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd300ldQ8VCH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms