Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sumf1Q8R0F3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sumf1Q8R0F3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sumf1Q8R0F3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sumf1Q8R0F3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sumf1Q8R0F3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms