Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrrdQ8K2M3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrdQ8K2M3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SrrdQ8K2M3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SrrdQ8K2M3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms