Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Otud6bQ8K2H2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Otud6bQ8K2H2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Otud6bQ8K2H2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms