Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rbm17Q8JZX4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rbm17Q8JZX4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rbm17Q8JZX4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rbm17Q8JZX4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rbm17Q8JZX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms