Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TwnkQ8CIW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TwnkQ8CIW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms