Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf31Q8CCF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prpf31Q8CCF0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf31Q8CCF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf31Q8CCF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms