Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A430089I19RikQ8C9W1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
A430089I19RikQ8C9W1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
A430089I19RikQ8C9W1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A430089I19RikQ8C9W1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms